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學(xué)校前身為二十世紀(jì)50年代初期創(chuàng)辦的南京市上新河中學(xué)和80年代創(chuàng)辦的南京市南湖一中兩校的高中部，2007年4月18日兩校合并命名為南京市建鄴高級中學(xué)。
至2017年，高中所有年級已搬至新校區(qū)--建鄴區(qū)富春江東街80號，整體占地面積66800平方米，在校生數(shù)998名，教職工共143名 。
